HDAC9

HDAC9
ساختارهای موجود PDB جستجوی هم‌ساخت‌شناسی: PDBe RCSB فهرست شناسه‌های PDB 1TQE
معین‌کننده‌ها
نام‌های دیگر	HDAC9, HD7, HD7b, HD9, HDAC, HDAC7, HDAC7B, HDAC9B, HDAC9FL, HDRP, MITR, histone deacetylase 9
شناسه‌های بیرونی	OMIM: 606543 MGI: 1931221 HomoloGene: 128578 GeneCards: HDAC9
موقعیت ژن (موش) کروموزوم کروموزوم ۱۲ (موش) نوار 12|12 A3 شروع 34,097,579 bp پایان 34,967,094 bp
هستی‌شناسی ژن عملکرد ملکولی • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific) • GO:0001106 transcription corepressor activity • histone deacetylase activity • protein deacetylase activity • transcription factor binding • histone deacetylase binding • metal ion binding • GO:0001948، GO:0016582 پیوند پروتئینی • hydrolase activity • protein kinase C binding • histone deacetylase activity (H4-K16 specific) ترکیبات سلولی • سیتوپلاسم • histone deacetylase complex • transcription regulator complex • نوکلئوپلاسم • هسته یاخته • histone methyltransferase complex فرایند زیستی • histone H3 deacetylation • peptidyl-lysine deacetylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis • response to amphetamine • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of striated muscle cell differentiation • transcription, DNA-templated • B cell activation • heart development • histone H4 deacetylation • neuron differentiation • cellular response to insulin stimulus • regulation of skeletal muscle fiber development • B cell differentiation • inflammatory response • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0031497، GO:0006336، GO:0034724، GO:0001301، GO:0007580، GO:0034652، GO:0010847 chromatin organization • histone deacetylation • cholesterol homeostasis • negative regulation of lipoprotein lipase activity • histone H4-K16 deacetylation منابع: آمیگو / کوئیک‌گو
هم‌ساخت‌شناسی
گونه‌ها	انسان	موش
Entrez	9734	79221
آنسامبل	ENSG00000048052	ENSMUSG00000004698
یونی‌پروت	Q9UKV0	Q99N13
RefSeq (mRNA)	NM_001204145، NM_001204146، NM_001204147، NM_001204148، NM_014707، NM_058176، NM_058177، NM_178423، NM_178425، NM_001321868، NM_001321869، NM_001321870، NM_001321871، NM_001321872، NM_001321873، NM_001321874، NM_001321875، NM_001321876، NM_001321877، NM_001321878، NM_001321879، NM_001321884، NM_001321885، NM_001321886، NM_001321887، NM_001321888، NM_001321889، NM_001321890، NM_001321891، NM_001321893، NM_001321894، NM_001321895، NM_001321896، NM_001321897، NM_001321898، NM_001321899، NM_001321900، NM_001321901، NM_001321902، NR_135835 NM_001204144، NM_001204145، NM_001204146، NM_001204147، NM_001204148، NM_014707، NM_058176، NM_058177، NM_178423، NM_178425، NM_001321868، NM_001321869، NM_001321870، NM_001321871، NM_001321872، NM_001321873، NM_001321874، NM_001321875، NM_001321876، NM_001321877، NM_001321878، NM_001321879، NM_001321884، NM_001321885، NM_001321886، NM_001321887، NM_001321888، NM_001321889، NM_001321890، NM_001321891، NM_001321893، NM_001321894، NM_001321895، NM_001321896، NM_001321897، NM_001321898، NM_001321899، NM_001321900، NM_001321901، NM_001321902، NR_135835	NM_024124، XM_006515261، XM_006515262، XM_006515264، XM_006515266، XM_006515271، XM_006515273، XM_006515275، XM_006515276، XM_011243911، XM_011243912، XM_011243913، XM_011243916، XM_011243918، XM_011243921، XM_011243922، XM_017315248، XM_017315249، XM_017315250، XM_017315251، XM_017315252، XM_030246984، XM_030246985، XM_030246986، XM_030246987، XM_030246988، XM_030246990، XM_030246991، XM_030246992، XM_036157669، XM_036157670، XM_036157671، XM_036157672، XM_036157673، XM_036157674، XM_036157675، XM_036157676، XM_036157677، XM_036157678، XM_036157679 NM_001271386، NM_024124، XM_006515261، XM_006515262، XM_006515264، XM_006515266، XM_006515271، XM_006515273، XM_006515275، XM_006515276، XM_011243911، XM_011243912، XM_011243913، XM_011243916، XM_011243918، XM_011243921، XM_011243922، XM_017315248، XM_017315249، XM_017315250، XM_017315251، XM_017315252، XM_030246984، XM_030246985، XM_030246986، XM_030246987، XM_030246988، XM_030246990، XM_030246991، XM_030246992، XM_036157669، XM_036157670، XM_036157671، XM_036157672، XM_036157673، XM_036157674، XM_036157675، XM_036157676، XM_036157677، XM_036157678، XM_036157679
RefSeq (پروتئین)	NP_001191074، NP_001191075، NP_001191076، NP_001191077، NP_001308797، NP_001308798، NP_001308799، NP_001308800، NP_001308801، NP_001308802، NP_001308803، NP_001308804، NP_001308805، NP_001308806، NP_001308807، NP_001308808، NP_001308813، NP_001308814، NP_001308815، NP_001308816، NP_001308817، NP_001308818، NP_001308819، NP_001308820، NP_001308822، NP_001308823، NP_001308824، NP_001308825، NP_001308826، NP_001308827، NP_001308828، NP_001308829، NP_001308830، NP_001308831، NP_055522، NP_478056، NP_848510، NP_848512 NP_001191073، NP_001191074، NP_001191075، NP_001191076، NP_001191077، NP_001308797، NP_001308798، NP_001308799، NP_001308800، NP_001308801، NP_001308802، NP_001308803، NP_001308804، NP_001308805، NP_001308806، NP_001308807، NP_001308808، NP_001308813، NP_001308814، NP_001308815، NP_001308816، NP_001308817، NP_001308818، NP_001308819، NP_001308820، NP_001308822، NP_001308823، NP_001308824، NP_001308825، NP_001308826، NP_001308827، NP_001308828، NP_001308829، NP_001308830، NP_001308831، NP_055522، NP_478056، NP_848510، NP_848512	NP_077038، XP_006515324، XP_006515325، XP_006515327، XP_006515329، XP_006515334، XP_006515336، XP_006515338، XP_006515339، XP_011242213، XP_011242214، XP_011242215، XP_011242218، XP_011242220، XP_011242223، XP_011242224، XP_017170737، XP_017170738، XP_017170739، XP_017170740، XP_017170741، XP_030102844، XP_030102845، XP_030102846، XP_030102847، XP_030102848، XP_030102850، XP_030102851، XP_030102852، XP_036013562، XP_036013563، XP_036013564، XP_036013565، XP_036013566، XP_036013567، XP_036013568، XP_036013569، XP_036013570، XP_036013571، XP_036013572 NP_001258315، NP_077038، XP_006515324، XP_006515325، XP_006515327، XP_006515329، XP_006515334، XP_006515336، XP_006515338، XP_006515339، XP_011242213، XP_011242214، XP_011242215، XP_011242218، XP_011242220، XP_011242223، XP_011242224، XP_017170737، XP_017170738، XP_017170739، XP_017170740، XP_017170741، XP_030102844، XP_030102845، XP_030102846، XP_030102847، XP_030102848، XP_030102850، XP_030102851، XP_030102852، XP_036013562، XP_036013563، XP_036013564، XP_036013565، XP_036013566، XP_036013567، XP_036013568، XP_036013569، XP_036013570، XP_036013571، XP_036013572
موقعیت (UCSC)	ن/م	Chr : 34.1 – 34.97 Mb
جستجوی PubMed
ویکی‌داده
مشاهده/ویرایش انسان مشاهده/ویرایش موش

هیستون دِاَستیلاز ۹ (انگلیسی: Histone deacetylase 9) یک آنزیم از اعضای خانوادهٔ هیستون دِاَستیلازها است که در انسان توسط ژن «HDAC9» واقع بر کروموزوم ۷ کُدگذاری می‌شود.

این پروتئین نقش بسیار مهمی در تنظیم رونویسی ژن‌ها، پیشرفتِ چرخهٔ سلولی و وقایع تکاملی سلول دارد.

هیستون دِاَستیلاز ۹، با مولکول HDAC3 و SIN3A تعامل پروتئین-پروتئین دارد.

منابع

• مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا. «HDAC9». در دانشنامهٔ ویکی‌پدیای انگلیسی، بازبینی‌شده در ۱۰ مارس ۲۰۲۰.

برای مطالعهٔ بیشتر

• Marks PA, Richon VM, Rifkind RA (August 2000). "Histone deacetylase inhibitors: inducers of differentiation or apoptosis of transformed cells". Journal of the National Cancer Institute. 92 (15): 1210–6. doi:10.1093/jnci/92.15.1210. PMID 10922406.
• Verdin E, Dequiedt F, Kasler HG (May 2003). "Class II histone deacetylases: versatile regulators". Trends in Genetics. 19 (5): 286–93. doi:10.1016/S0168-9525(03)00073-8. PMID 12711221.
• Sanger Centre, The; Washington University Genome Sequencing Cente, The (November 1998). "Toward a complete human genome sequence". Genome Research. 8 (11): 1097–108. doi:10.1101/gr.8.11.1097. PMID 9847074.
• Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (October 1998). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XI. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro". DNA Research. 5 (5): 277–86. doi:10.1093/dnares/5.5.277. PMID 9872452.
• Miska EA, Karlsson C, Langley E, Nielsen SJ, Pines J, Kouzarides T (September 1999). "HDAC4 deacetylase associates with and represses the MEF2 transcription factor". The EMBO Journal. 18 (18): 5099–107. doi:10.1093/emboj/18.18.5099. PMC 1171580. PMID 10487761.
• Zhou X, Richon VM, Rifkind RA, Marks PA (February 2000). "Identification of a transcriptional repressor related to the noncatalytic domain of histone deacetylases 4 and 5". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 97 (3): 1056–61. doi:10.1073/pnas.97.3.1056. PMC 15519. PMID 10655483.
• Youn HD, Grozinger CM, Liu JO (July 2000). "Calcium regulates transcriptional repression of myocyte enhancer factor 2 by histone deacetylase 4". The Journal of Biological Chemistry. 275 (29): 22563–7. doi:10.1074/jbc.C000304200. PMID 10825153.
• Zhang CL, McKinsey TA, Lu JR, Olson EN (January 2001). "Association of COOH-terminal-binding protein (CtBP) and MEF2-interacting transcription repressor (MITR) contributes to transcriptional repression of the MEF2 transcription factor". The Journal of Biological Chemistry. 276 (1): 35–9. doi:10.1074/jbc.M007364200. PMID 11022042.
• Fischle W, Dequiedt F, Fillion M, Hendzel MJ, Voelter W, Verdin E (September 2001). "Human HDAC7 histone deacetylase activity is associated with HDAC3 in vivo". The Journal of Biological Chemistry. 276 (38): 35826–35. doi:10.1074/jbc.M104935200. PMID 11466315.
• Zhou X, Marks PA, Rifkind RA, Richon VM (September 2001). "Cloning and characterization of a histone deacetylase, HDAC9". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 98 (19): 10572–7. doi:10.1073/pnas.191375098. PMC 58507. PMID 11535832.
• Koipally J, Georgopoulos K (June 2002). "Ikaros-CtIP interactions do not require C-terminal binding protein and participate in a deacetylase-independent mode of repression". The Journal of Biological Chemistry. 277 (26): 23143–9. doi:10.1074/jbc.M202079200. PMID 11959865.
• Kirsh O, Seeler JS, Pichler A, Gast A, Müller S, Miska E, Mathieu M, Harel-Bellan A, Kouzarides T, Melchior F, Dejean A (June 2002). "The SUMO E3 ligase RanBP2 promotes modification of the HDAC4 deacetylase". The EMBO Journal. 21 (11): 2682–91. doi:10.1093/emboj/21.11.2682. PMC 125385. PMID 12032081.
• Mahlknecht U, Schnittger S, Will J, Cicek N, Hoelzer D (April 2002). "Chromosomal organization and localization of the human histone deacetylase 9 gene (HDAC9)". Biochemical and Biophysical Research Communications. 293 (1): 182–91. doi:10.1016/S0006-291X(02)00193-6. PMID 12054582.
• Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN (October 2002). "Association of class II histone deacetylases with heterochromatin protein 1: potential role for histone methylation in control of muscle differentiation". Molecular and Cellular Biology. 22 (20): 7302–12. doi:10.1128/MCB.22.20.7302-7312.2002. PMC 139799. PMID 12242305.
• Hoogeveen AT, Rossetti S, Stoyanova V, Schonkeren J, Fenaroli A, Schiaffonati L, van Unen L, Sacchi N (September 2002). "The transcriptional corepressor MTG16a contains a novel nucleolar targeting sequence deranged in t (16; 21)-positive myeloid malignancies". Oncogene. 21 (43): 6703–12. doi:10.1038/sj.onc.1205882. PMID 12242670.
• Petrie K, Guidez F, Howell L, Healy L, Waxman S, Greaves M, Zelent A (May 2003). "The histone deacetylase 9 gene encodes multiple protein isoforms". The Journal of Biological Chemistry. 278 (18): 16059–72. doi:10.1074/jbc.M212935200. PMID 12590135.

پیوند به بیرون

• HDAC9 protein, human در سرعنوان‌های موضوعی پزشکی (MeSH) در کتابخانهٔ ملی پزشکی ایالات متحدهٔ آمریکا