اگریکان

ACAN
ساختارهای موجود
PDB	جستجوی هم‌ساخت‌شناسی: PDBe RCSB
فهرست شناسه‌های PDB
	4MD4
معین‌کننده‌ها
نام‌های دیگر	ACAN, AGC1, AGCAN, CSPG1, CSPGCP, MSK16, SEDK, Aggrecan, SSOAOD
شناسه‌های بیرونی	OMIM: 155760 MGI: 99602 HomoloGene: 136177 GeneCards: ACAN
موقعیت ژن (موش)
کروموزوم	کروموزوم ۷ (موش)
پایان	78,764,847 bp
الگوی گسترش RNA
	; ; ; ;
	More reference expression data
هستی‌شناسی ژن
عملکرد ملکولی	• extracellular matrix structural constituent; • metal ion binding; • GO:0001948، GO:0016582 پیوند پروتئینی; • hyaluronic acid binding; • carbohydrate binding; • extracellular matrix structural constituent conferring compression resistance;
ترکیبات سلولی	• GO:0005578 بافت‌مانه برون‌یاخته‌ای; • extracellular region; • lysosomal lumen; • Golgi lumen; • غشای پایه; • collagen-containing extracellular matrix; • perisynaptic extracellular matrix; • glutamatergic synapse; • GABA-ergic synapse;
فرایند زیستی	• skeletal system development; • extracellular matrix disassembly; • extracellular matrix organization; • پروتئین‌کافت; • central nervous system development; • keratan sulfate catabolic process; • keratan sulfate biosynthetic process; • چسبندگی سلولی; • cartilage condensation; • chondrocyte development; • heart development; • proteoglycan biosynthetic process; • collagen fibril organization;
	منابع: آمیگو / کوئیک‌گو
هم‌ساخت‌شناسی
	176
	11595
	ENSG00000157766
	ENSMUSG00000030607
	P16112
	Q61282
	NM_001135، NM_013227، XM_011521313، NM_001369268، XM_047432214، XM_047432215، XM_047432216، XM_047432217 XM_011521314، NM_001135، NM_013227، XM_011521313، NM_001369268، XM_047432214، XM_047432215، XM_047432216، XM_047432217
	NM_001361500 NM_007424، NM_001361500
	NP_037359، XP_011519615، XP_011519616، NP_001356197 NP_001126، NP_037359، XP_011519615، XP_011519616، NP_001356197
	NP_001348429 NP_031450، NP_001348429
	ویکی‌داده
مشاهده/ویرایش انسان	مشاهده/ویرایش موش

اگریکان (انگلیسی: Aggrecan؛ تلفظ صحیح: اَگریکَن)^[۴] که یک پروتئوگلیکان است توسط ژن ACAN کُدگذاری می‌شود.^[۵] اگریکان یکی از پروتئین‌های سازنده ماتریکس برون سلولی در بافت‌های غضروفی می‌باشد و قابلیت تحمل بار را دارد.

ساختار[ویرایش]

اگریکان یک گلیکوپروتئین با وزن مولکولی بالا (1x10^6 <M <3x10^۶) می‌باشد. ساختار آن شبیه به شیشه شور است، که در آن شاخه‌های کاندرویتین سولفات و کراتین سولفات به یک پروتئین مرکزی وصل هستند^[۶]

جرم مولکولی اگریکان بیشتر از 2500 kDa است و در آن بین ۱۰۰ تا ۱۵۰ شاخه گلیکو آمینو گلیکان (GAG) به پروتئین مرکزی وصل می‌باشد. اگریکان و کلاژن نوع II اصلی‌ترین تشکیل دهنده‌های غضروف هستند.

عملکرد[ویرایش]

اگریکان به دلیل بار منفی بالایی که در شاخه‌های GAG دارد، قابلیت مقاومت در مقابلا فشار را به بافت می‌دهد. نیمی از سفتی غضروف به دلیل وجود اگریکان می‌باشد. خاصیت بارداری بالای اگریکان باعث ایجاد فشار اسمزی در بافت نیز می‌شود.

اهمیت پزشکی[ویرایش]

اگریکان بسیار به پروتئین‌کافت (proteolysis) حساس می‌باشد. تحلیل اگریکان به شروع و توسعه آرتروز ارتباط داده شده‌است.

جستارهای وابسته[ویرایش]

پروتئوگلیکان

منابع[ویرایش]

↑ ^۱٫۰ ^۱٫۱ ^۱٫۲ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030607 - Ensembl, May 2017
↑ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ «How to pronounce aggrecan».
↑ Doege KJ, Sasaki M, Kimura T, Yamada Y (1991). "Complete coding sequence and deduced primary structure of the human cartilage large aggregating proteoglycan, aggrecan. Human-specific repeats, and additional alternatively spliced forms". J. Biol. Chem. 266 (2): 894–902. PMID 1985970. {{cite journal}}: Unknown parameter |month= ignored (help)نگهداری یادکرد:نام‌های متعدد:فهرست نویسندگان (link)
↑ Nap RJ, Szleifer I (2008). "Structure and interactions of aggrecans: statistical thermodynamic approach". Biophys. J. 95 (10): 4570–83. doi:10.1529/biophysj.108.133801. PMC 2576360. PMID 18689463. {{cite journal}}: Unknown parameter |month= ignored (help)

بیشتر بخوانید[ویرایش]

Watanabe H, Yamada Y, Kimata K (1998). "Roles of aggrecan, a large chondroitin sulfate proteoglycan, in cartilage structure and function". J. Biochem. 124 (4): 687–93. doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022166. PMID 9756610.
Fosang AJ, Neame PJ, Last K, Hardingham TE, Murphy G, Hamilton JA (1992). "The interglobular domain of cartilage aggrecan is cleaved by PUMP, gelatinases, and cathepsin B". J. Biol. Chem. 267 (27): 19470–4. PMID 1326552.
Sandy JD, Flannery CR, Neame PJ, Lohmander LS (1992). "The structure of aggrecan fragments in human synovial fluid. Evidence for the involvement in osteoarthritis of a novel proteinase which cleaves the Glu 373-Ala 374 bond of the interglobular domain". J. Clin. Invest. 89 (5): 1512–6. doi:10.1172/JCI115742. PMC 443022. PMID 1569188.
Baldwin CT, Reginato AM, Prockop DJ (1989). "A new epidermal growth factor-like domain in the human core protein for the large cartilage-specific proteoglycan. Evidence for alternative splicing of the domain". J. Biol. Chem. 264 (27): 15747–50. PMID 2789216.
Kimata K, Barrach HJ, Brown KS, Pennypacker JP (1981). "Absence of proteoglycan core protein in cartilage from the cmd/cmd (cartilage matrix deficiency) mouse". J. Biol. Chem. 256 (13): 6961–8. PMID 7240256.
Glumoff V, Savontaus M, Vehanen J, Vuorio E (1994). "Analysis of aggrecan and tenascin gene expression in mouse skeletal tissues by northern and in situ hybridization using species specific cDNA probes". Biochim. Biophys. Acta. 1219 (3): 613–22. doi:10.1016/0167-4781(94)90220-8. PMID 7524681.
Ilic MZ, Mok MT, Williamson OD, Campbell MA, Hughes CE, Handley CJ (1995). "Catabolism of aggrecan by explant cultures of human articular cartilage in the presence of retinoic acid". Arch. Biochem. Biophys. 322 (1): 22–30. doi:10.1006/abbi.1995.1431. PMID 7574678.
Valhmu WB, Palmer GD, Rivers PA, Ebara S, Cheng JF, Fischer S, Ratcliffe A (1995). "Structure of the human aggrecan gene: exon-intron organization and association with the protein domains". Biochem. J. 309. 309 (2): 535–42. doi:10.1042/bj3090535. PMC 1135764. PMID 7626017.
Barry FP, Neame PJ, Sasse J, Pearson D (1994). "Length variation in the keratan sulfate domain of mammalian aggrecan". Matrix Biol. 14 (4): 323–8. doi:10.1016/0945-053X(94)90198-8. PMID 7827755.
Fosang AJ, Last K, Neame PJ, Murphy G, Knäuper V, Tschesche H, Hughes CE, Caterson B, Hardingham TE (1994). "Neutrophil collagenase (MMP-8) cleaves at the aggrecanase site E373-A374 in the interglobular domain of cartilage aggrecan". Biochem. J. 304. 304 (2): 347–51. PMC 1137499. PMID 7998967.
Fosang AJ, Last K, Knäuper V, Neame PJ, Murphy G, Hardingham TE, Tschesche H, Hamilton JA (1993). "Fibroblast and neutrophil collagenases cleave at two sites in the cartilage aggrecan interglobular domain". Biochem. J. 295. 295 (1): 273–6. PMC 1134849. PMID 8216228.
Korenberg JR, Chen XN, Doege K, Grover J, Roughley PJ (1993). "Assignment of the human aggrecan gene (AGC1) to 15q26 using fluorescence in situ hybridization analysis". Genomics. 16 (2): 546–8. doi:10.1006/geno.1993.1228. PMID 8314595.
Dudhia J, Davidson CM, Wells TM, Vynios DH, Hardingham TE, Bayliss MT (1996). "Age-related changes in the content of the C-terminal region of aggrecan in human articular cartilage". Biochem. J. 313. 313 (3): 933–40. doi:10.1042/bj3130933. PMC 1217001. PMID 8611178.
Fülöp C, Cs-Szabó G, Glant TT (1996). "Species-specific alternative splicing of the epidermal growth factor-like domain 1 of cartilage aggrecan". Biochem. J. 319. 319 (3): 935–40. doi:10.1042/bj3190935. PMC 1217878. PMID 8921002.
Kirschfink M, Blase L, Engelmann S, Schwartz-Albiez R (1997). "Secreted chondroitin sulfate proteoglycan of human B cell lines binds to the complement protein C1q and inhibits complex formation of C1". J. Immunol. 158 (3): 1324–31. PMID 9013976.
Parkar AA, Kahmann JD, Howat SL, Bayliss MT, Day AJ (1998). "TSG-6 interacts with hyaluronan and aggrecan in a pH-dependent manner via a common functional element: implications for its regulation in inflamed cartilage". FEBS Lett. 428 (3): 171–6. doi:10.1016/S0014-5793(98)00523-7. PMID 9654129.
Fosang AJ, Last K, Fujii Y, Seiki M, Okada Y (1998). "Membrane-type 1 MMP (MMP-14) cleaves at three sites in the aggrecan interglobular domain". FEBS Lett. 430 (3): 186–90. doi:10.1016/S0014-5793(98)00667-X. PMID 9688535.
"Aggrecan". Learning Center. Sigma-Aldrich Company. Retrieved 2011-10-24.

پیوند به بیرون[ویرایش]

Aggrecan در سرعنوان‌های موضوعی پزشکی (MeSH) در کتابخانهٔ ملی پزشکی ایالات متحدهٔ آمریکا
مکان ژنوم ACAN انسانی و صفحهٔ جزئیات ژنی ACAN در سامانه جستجوی بانک ژنی دانشگاه کالیفرنیا، سانتا کروز.

[refGRCm38Ensembl-1] ۱٫۰ ^۱٫۱ ^۱٫۲ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030607 - Ensembl, May 2017

[2] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[3] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] «How to pronounce aggrecan».

[pmid_1985970-5] Doege KJ, Sasaki M, Kimura T, Yamada Y (1991). "Complete coding sequence and deduced primary structure of the human cartilage large aggregating proteoglycan, aggrecan. Human-specific repeats, and additional alternatively spliced forms". J. Biol. Chem. 266 (2): 894–902. PMID 1985970. {{cite journal}}: Unknown parameter |month= ignored (help)نگهداری یادکرد:نام‌های متعدد:فهرست نویسندگان (link)

[pmid_18689463-6] Nap RJ, Szleifer I (2008). "Structure and interactions of aggrecans: statistical thermodynamic approach". Biophys. J. 95 (10): 4570–83. doi:10.1529/biophysj.108.133801. PMC 2576360. PMID 18689463. {{cite journal}}: Unknown parameter |month= ignored (help)

[۱]

[۲]

[۳]

[۴]

[۵]

[۶]